密尔沃基雄鹿 (2005-2012)
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雄鹿队时期的博古特
2005年NBA选秀，安德鲁·博古特在首轮以第1顺位被密尔沃基雄鹿选中。他是NBA联盟历史上第一位来自大洋洲的选秀状元。
2006年2月2日，NBA公布参加2006年全明星周末的新秀挑战赛球员名单，博古特入选一年级队。
2006年5月5日，NBA官方公布2005-06赛季的最佳新秀阵容名单，博古特入选最佳新秀阵容一队。他平均每场得到7.0个篮板和0.83次封盖，排在所有新秀首位。
2007年2月1日，NBA公布参加2007年全明星周末的新秀挑战赛球员名单，博古特入选二年级队。
2010年4月4日，在雄鹿和太阳的比赛中，博古特严重受伤导致赛季报销。
2010年5月7日，NBA官方公布2009-10赛季的最佳阵容名单，博古特入选最佳阵容三队。该赛季，博古特场均拿下15.9分10.2篮板2.5封盖，作为球队内线核心把雄鹿队重新带回季后赛。
2010-11赛季，博古特场均得到12.8分和11.1个篮板，并以场均2.6次阻攻成为封阻王。
2011-12赛季，博古特仅打了12场比赛，就因伤赛季报销，并于2012年4月接受了左脚踝微创手术。
金州勇士 (2012-2016)
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2012年3月14日，金州勇士送出蒙塔·埃利斯、艾派·尤度和夸梅·布朗，从密尔瓦基公鹿交易得到博古特和斯蒂芬·杰克逊。
2013年4月21日，勇士对阵丹佛掘金的首场季后赛中，博古特全场贡献9分14篮板4阻攻，成为自1989年拉里·史密斯之后首位在季后赛客场比赛中拿到至少11篮板3阻攻的勇士球员。
2013年5月3日，勇士对阵丹佛掘金，博古特全场拿到21个篮板，成为自1987年以来第一次在季后赛中拿到单场20+篮板数的勇士球员。
2015年3月19日，勇士主场114-92战胜亚特兰大鹰，博古特上场22分钟，3投0中得到0分14个篮板。这是他职业生涯首次抢到10个篮板却没得分的比赛，也是他职业生涯第5次上场超过15分钟没得分的比赛。
2015年5月21日，NBA官方公布2014-15赛季的最佳防守阵容，博古特入选最佳防守阵容二队。
2015年5月22日，勇士主场99-98战胜休士敦火箭，系列赛大比分2-0领先。博古特送出5个阻攻，刷新职业生涯季后赛单场阻攻纪录。
2015年6月17日，勇士以总比分4-2战胜克里夫兰骑士，博古特随队获得NBA总冠军。
2016年6月20日，勇士二次挑战总冠军赛，因不慎在第五战与J·R·史密斯碰撞后受伤，最终勇士以3:4输给克里夫兰骑士。
达拉斯小牛 - 费城76人 - 克里夫兰骑士 (2016-2017)
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2016年7月5日，因凯文·杜兰特的加盟，勇士将波格特、哈里森·巴恩斯打包交易至达拉斯小牛。
2017年2月23被交易至费城76人，但随即被裁掉，3月2号以底薪加入克里夫兰骑士。3月6号为骑士上场第一场比赛不过仅上场不到1分钟时间就因为碰撞后左脚受伤伤退并留下两次犯规的纪录退场，初期经X光检查后判定为左腿胫骨骨折但需要进一步检查，经检查后确定为左腿胫骨骨折本季确定提前报销，意外受伤确定报销后骑士随即把他释出改签约曾效力过密尔瓦基公鹿的拉里·桑德斯。
洛杉矶湖人 (2017-2018)
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2017年9月18日，澳洲中锋博古特已经同意加盟湖人，双方预计会签下一年底薪合约，价码约230万美元。博古特将与罗培兹(Brook Lopez)和大前锋蓝道(Julius Randle)联手捍卫紫金军团的禁区，预计将是罗培兹的替补。与前洛杉矶湖人总教练卢克·沃尔顿再度合作。
2018年1月6日，被湖人队释出，成为自由球员。
2018年4月23日，博古特提到他的合约中没有跳出加入NBA或是欧洲联盟的选项，他会与Sydney Kings签约2年并且表示自己已经从NBA退休了，博古特提到他跟Sydney Kings的交易让他成为球队股东之一，他有10%的股份，做为交易的
一部分，事实上他想要50%的股份。
金州勇士 (2019)
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在结束澳洲国家篮球联赛的赛季后，2019年3月6日，博古特与NBA金州勇士签下底薪合约，重回NBA舞台。他后来一部分时间也担任正选。
退休
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透过自家Podcast节目，宣布自己将结束职业篮球生涯，此外他也透露不会寻求在顺延的2021年东京奥运代表澳洲出赛。